José Richard Baptista Gomes
  Investigador Principal  
   
  telefone: 234 401 423  
  extensão: 24 923  
  e-mail: jrgomes@ua.pt  
  departamento: Química  
  gabinete: 29.3.34  
   
  grupo: 6 - simulação computacional e modelação multi-escala
 
  linha: 1 - tecnologias da informação e comunicação
 
  url directo: http://www.ciceco.ua.pt/JoseRGomes  
   
Perfil biográfico

Researcher ID
ORCID

 

1991-1995
- Licenciatura em Química, Faculdade de Ciências da Universidade do Porto.

1995-2000
- Doutoramento em Química pela Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (área da Química Computacional), onde se dedicou ao estudo de processos químicos sobre superfícies de metais de transição, sob a supervisão do Prof. Doutor José A. N. Ferreira Gomes. Grau obtido no dia 5 de Janeiro de 2000.

2000
- Pós-doutoramento no Departament de Química Física da Facultat de Química de Barcelona, Espanha, onde fez trabalho de investigação sobre a adsorção em óxidos metálicos, no âmbito de um programa de pós-doutoramento sob orientação do Prof. Doutor Francesc Illas;

2001-2007
-Investigador pós-doutoral no grupo de Termoquímica da Faculdade de Ciências do Porto, dedicando-se à aplicação de técnicas de Química-Computacional em estudos estruturais e termodinâmicos de compostos aromáticos heterocíclicos e de complexos de coordenação com metais de transição, sob a orientação do Prof. Doutor Manuel A. V. Ribeiro da Silva.


2007-2012
- Investigador auxiliar (programa Ciência 2007) no Laboratório Associado CICECO.

2012-2013
- Investigador auxiliar no Laboratório Associado CICECO.

2013-presente
- Investigador principal no Laboratório Associado CICECO.

 

Coordena o Grupo 6.

Interesses científicos

Uso de computadores e métodos computacionais em química.


Palavras-chave:

- Estrutura molecular
- Termoquímica em fase gasosa
- Perfis de reacções em fase gasosa
- Adsorção química e/ou física
- Reacções em superfícies (metálicas ou óxidos metálicos)
- Catálise heterogénea

Projectos financiados

ATIVOS

Coordenador das Missões Científicas de Curto Prazo (STSMs) da Ação COST Computational materials sciences for efficient water splitting with nanocrystals from abundant elements (CA 18234).

Membro da equipa do projeto Delivery vehicles of therapeutic gasotransmitters NO and H2S based on nanoporous materials (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. PTDC/MED-QUI/28721/2017, de 01-10-2018 a 30-09-2021).

Co-investigador principal do projeto DataCor - Smart Data to Design Corrosion Inhibitors (Compete 2020, ref. PTDC/QUI-QFI/30256/2017, de 16-07-2018 a 15-07-2021).

Investigador principal do projeto SILVIA - Modeling the synthesis of silica materials via multiscale computer simulations (Programa Operacional Centro 2020, ref. PTDC/QUI-QFI/31002/2017, de 01-06-2018 a 31-05-2021).
 

CONCLUÍDOS

Investigador principal do projeto Modeling the synthesis of silica materials with a novel reactive coarse-grained model (RES - Red Española de Supercomputación, ref. QS-2019-2-0034).

Membro da equipa do projeto Dissociation mechanism of water on two-dimensional transition metal carbides (MXenes) (RES - Red Española de Supercomputación, ref. QS-2019-2-0019).

Investigador principal do projeto SELMA - Unveiling the self-healing mechanisms associated with smart nanocontainers (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. PTDC/QEQ-QFI/4719/2014).

Membro da equipa do projeto Variable pressure solid-state NMR methods to study gas-surface interactions in nanoporous sorbent materials for industrial post/pre-combustion CO2 capture (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. PTDC/QEQ-QAN/6373/2014).

Membro da equipa do projeto TUBITAK - Phase transitions and ferroelectricity in self-assembled peptides nanotubes (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. TUBITAK/0006/2014).

Membro da equipa do projeto UNIRCELL - Unitised regenerative fuel cell for efficient renewable energy supply: from materials to device (FCT-COMPETE / Programas de Atividades Conjuntas do Portugal 2020, ref. POCI-01-0145-FEDER-016422).

Membro da equipa do projeto SUSPHOTOSOLUTIONS - Soluções Fotovoltaicas Sustentáveis (Programa Operacional Centro 2020, ref. CENTRO-01-0145-FEDER-000005).

Membro da equipa do projeto SGH - Smart Green Homes (Sistema de Incentivos à I&D Empresarial, ref. POCI-01-0247-FEDER-007678).

Participante no projeto CO adsorption in MXenes (European Commission - HPC-EUROPA3, ref. INFRAIA-2016-1-730897).

Membro da equipa do projeto FISHING - Fishing falcipain hit inhibitors from Malaria Boxes: in silico target deconvolution model development and validation (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. EXPL/QEQ-COM/0927/2013).

Investigador principal do projeto CODECAT - COmputational DEsign of new CATalysts for the water gas shift reaction (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. PTDC/QUI-QUI/117439/2010).

Investigador principal do projeto SILICAT - Theoretical Study of Silicate Chemistry in the Synthesis of Nanoporous Materials (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. PTDC/QUI-QUI/109914/2009).

Membro da equipa do projeto Development of high-resolution 1H solid-state NMR methods and applications on materials and molecules of biological interest (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. PTDC/QUI-QUI/100998/2008).

Membro da equipa do projeto Synthesis and Characterization of New Microporous Niobium Silicate and Titanosilica Membranes and Their Application to the Separation of Hydrogen-containing Mixtures (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. PTDC/EQU-EQU/100476/2008).

Membro da equipa do projeto Intelligent Design of Mesoporous Organosilicas for Adsorptive Separation Processes (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. PTDC/EQU-EQU/099423/2008).

 

Publicações seleccionadas

Lista completa: http://sweet.ua.pt/jrgomes/publications.html

Publicações mais recentes:

2020

Self-Consistent Electrostatic Embedding for Liquid Phase Polarization
M. Jorge, José R. B. Gomes, Andrew W. Milne
J. Mol. Liquids, accepted for publication. []

Revisiting Tracer Liu-Silva-Macedo model for binary diffusion coefficient using the largest database of liquid and supercritical systems
B. Zêzere, I. Portugal, José R. B. Gomes, Carlos M. Silva
J. Supercrit. Fluid. , accepted for publication. []

Unveiling the local structure of 2-mercaptobenzothiazole intercalated in (Zn2Al) layered double hydroxides
G. Novell-Leruth, G. Pérez-Sánchez, T. L. P. Galvão, D. Boiba, P. Syargei, J. Carneiro, J. Tedim, José R. B. Gomes
Appl. Clay Sci., 198 (2020) 105842. [link]

First-principles calculations of the adsorption behavior of amino acids on a titanium carbide MXene
J. D. Gouveia, G. Novell-Leruth, P. Reis, F. Viñes, F.Illas, José R. B. Gomes
ACS Appl. Bio Mater., 3 (2020) 5913. [link]

Mesoscale model of the synthesis of periodic mesoporous benzene-silica
J. D. Gouveia, G. Pérez-Sánchez, S. M. Santos, A. P. Carvalho, José R. B. Gomes, M. Jorge
J. Mol. Liquids, 316 (2020) 113861. [link]

Surface Enhanced Raman Scattering Due to a Synergistic Effect in ZnS and Graphene Oxide
J. Lopes, S. Fateixa, A. Estrada, J. D. Gouveia, José R. B. Gomes, T. Trindade
J. Phys. Chem. C, 124 (2020) 12742. [link]

MXenes atomic layer stacking phase transitions and their chemical activity consequences
J. D. Gouveia, F. Viñes, F.Illas, José R. B. Gomes
Phys. Rev. Materials, 4 (2020) 054003. [link]

Facile Heterogeneously Catalyzed Nitrogen Fixation by MXenes
J. D. Gouveia, Á. Morales-García, F. Viñes, José R. B. Gomes, F. Illas
ACS Catal., 10 (2020) 5049. [link]

The Cation Effect on the Solubility of Glycylglycine and N-Acetylglycine in Aqueous Solution: Experimental and Molecular Dynamics Studies
G. Pérez-Sánchez, Y. S. Santos, O. Ferreira, J. A. P. Coutinho, José R. B. Gomes, S. P. Pinho
J. Mol. Liq., 310 (2020) 113044. [link]

Non-ionic hydrophobic eutectics - versatile solvents for tailored metal separation and valorisation
N. Schaeffer, J. H. F. Conceição, M. A. R. Martins, M. C. Neves, G. Pérez-Sánchez, José R. B. Gomes, N. Papaiconomou, J. A. P. Coutinho
Green Chem., 22 (2020) 2810. [link]

Novel insights on biomass delignification with acidic deep eutectic solvents: a mechanistic study of ß-O-4 ether bond cleavage and the role of the halide counterion on the catalytic performance
A. M. da Costa Lopes, José R. B. Gomes, J. A. P. Coutinho, A. Silvestre
Green Chem., 22 (2020) 2474. [link]

Elucidating Structure-Property Relationships in Aluminum Alloy Corrosion Inhibitors by Machine Learning
T. L. P. Galvão, G. Novell-Leuth, A. Kuznetsova, J. Tedim, José R. B. Gomes
J. Phys. Chem. C, 124 (2020) 5624. [link]
Virtual Special Issue: Machine Learning in Physical Chemistry

Cinnamic derivatives as antitubercular agents: characterization by quantitative structure-activity relationship studies
C. Teixeira, C. Ventura, José R. B. Gomes, P. Gomes, F. Martins
Molecules, 25 (2020) 456. [link]

A Computational Study of the Interaction of C2 Hydrocarbons with CuBTC
R. Afonso, J. Toda, José R. B. Gomes, M. Fischer, C. Campbell, M. Jorge
Comput. Mater. Sci., 173 (2020) 109438. [link]

The Effect of Atomic Point Charges on Adsorption Isotherms of CO2 and Water in Metal Organic Frameworks
K. Sladekova, C. Campbell, C. Grant, A. J. Fletcher, José R. B. Gomes, M. Jorge
Adsorption, 26 (2020) 663. [link]

MXenes as promising catalysts for water dissociation
J. D. Gouveia, Á. Morales-García, F. Viñes, F. Illas, José R. B. Gomes
Appl. Catal. B.: Environ., 260 (2020) 118191. [link]

Measurement of astaxanthin and squalene diffusivities in compressed liquid ethyl acetate by Taylor-Aris dispersion method
B. Zêzere, J. M. Silva, I. Portugal, José R. B. Gomes, C. M. Silva
Sep. Purif. Technol., 234 (2020) 116046. [link]

 

Principais colaboradores
  • Nacionais:
    • Prof. Doutor João Paulo Prates Ramalho (Universidade de Évora);
    • Doutor Luís Mafra (Universidade de Aveiro);
    • Doutor Moisés Luzia Pinto (Instituto Superior Técnico);
    • Doutora Paula Ferreira (Universidade de Aveiro);
    • Prof. Doutor João Coutinho (Universidade de Aveiro);
    • Doutor João Tedim (Universidade de Aveiro);
    • Doutor Filipe Figueiredo (Universidade de Aveiro).

 

  • Internacionais:
    • Prof. Doutor Francesc Illas (Universidade de Barcelona, Espanha);
    • Doutor Francesc Viñes (Universidade de Barcelona, Espanha);
    • Doutor Miguel Jorge (Universidade de Strathclyde, Reino Unido);
    • Doutor Michael Fischer (Universidade de Bremen, Alemanha).
Grupo de Investigação

Investigadores com Doutoramento:

  • Rui Vieira Afonso (Portugal) – Cálculos DFT da interação de pequenas moléculas com adsorventes sólidos.
  • Tiago Luís Pereira Galvão (Portugal) – Cálculos DFT da interação de inibidores de corrosão com superfícies metálicas. Aproximações de Machine Learning.
  • Gerard Novell-Leruth (Espanha) - Cálculos DFT e de dinâmica molecular clássica da interação de inibidores de corrosão com materiais diversos.
  • José Daniel Gouveia (Portugal) – Estudos de dinâmica molecular clássica de soluções aquosas de sílica. Cálculos DFT de reações catalíticas em superfícies diversas.

 

Investigadores sem Doutoramento:

  • Marcos André Carvalho (Portugal) – co-orientação com Doutor Sérgio Santos, Aveiro. Desenvolvimento de um modelo reativo para simulações de dinâmica molecular da reação de síntese de sílicas porosas.

 

Estudantes de Doutoramento:

  • Manon Wilhelm (França) – co-orientação com Doutor João Tedim, Aveiro. Cálculos DFT com vista ao desenho de novos eletrocatalisadores para a dissociação de água.
  • Mehriban Aliyeva (Azerbaijão) – co-orientação com Prof. Doutor João Coutinho, Aveiro. Simulações de dinâmica molecular clássica de fragmentos proteicos em soluções aquosas.
  • Bruno Zêzere (Portugal) – co-orientação com Prof. Doutor Carlos Silva, Aveiro. Simulações de dinâmica molecular clássica para o cálculo de coeficientes de difusão de compostos bioativos em fluidos supercríticos e em líquidos.
  • Tiago Vieites Branco Fonseca (Portugal) – co-orientação com Prof. Doutor Carlos Silva, Aveiro e com Prof. Mário Quialheiro Simões, Aveiro. Simulações de dinâmica molecular clássica para o cálculo de coeficientes de difusão de compostos bioativos em fluidos supercríticos e em líquidos.
  • Marta Gomes Figueira de Almeida Bordonhos (Portugal) - co-orientação com Prof. Doutor Moisés Luzia Pinto, Lisboa. Cálculos DFT e simulações GCMC da adsorção de gases em materiais porosos.

 

Actividade pedagógica

Universidade do Porto

1996/97
- Foi monitor da disciplina de Introdução à Química I das Licenciaturas de Física, de Física e Tecnologia dos Materiais e de Optoelectrónica e Lasers, da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, tendo a seu cargo a leccionação das aulas práticas (componentes teórico-práticas e laboratorial).

1998/99
- Foi monitor da disciplina de Tecnologias de Informação e Comunicação da Licenciatura em Química, da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, tendo a seu cargo a leccionação das aulas práticas.
- Foi monitor da disciplina de Energia e Organização em Sistemas Biológicos da Licenciatura em Bioquímica, da mesma Faculdade, tendo a seu cargo a leccionação das aulas práticas.

2002-2007
- Leccionou uma aula/4h subordinada ao tema “Aplicação da Química Computacional em Estudos Termoquímicos”, no âmbito da disciplina de Termoquímica, opção da Licenciatura em Química da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, a convite da Profª Doutora Maria das Dores M. C. Ribeiro da Silva.

Co-autor da publicação pedagógica:
Termoquímica: Aulas práticas (disciplina de opção do 3º ano da Licenciatura em Química) Maria das Dores M. C. Ribeiro da Silva, Luís M. N. B. F. Santos, José R. B. Gomes Departamento de Química, Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, Fevereiro de 2005.

 

Universidade de Aveiro

2015/16
- Leccionou o módulo de Visualização e Modelação Molecular (56 h) da disciplina de Bioinformática e Estrutura Molecular destinado a alunos do 3º ano das Licenciaturas em Bioquímica e em Biotecnologia.

2016/17
- Teve a seu cargo 4 turmas (componente laboratorial - aulas práticas) da disciplina de Elementos de Química Física, destinada a alunos do 1º ano de diversas Licenciaturas e Mestrados Integrados nas áreas das Ciências e das Engenharias da Universidade de Aveiro.
- Teve a seu cargo 2 turmas (componente laboratorial - aulas práticas) da disciplina de Química Geral, destinada a alunos do 1º ano de diversas Licenciaturas e Mestrados Integrados nas áreas das Ciências e das Engenharias da Universidade de Aveiro.

2017/18
- Teve a seu cargo 2 turmas (componente laboratorial - aulas práticas) da disciplina de Química Geral, destinada a alunos do 1º ano de diversas Licenciaturas e Mestrados Integrados nas áreas das Ciências e das Engenharias da Universidade de Aveiro.

2018/19
- Teve a seu cargo 2 turmas (componente laboratorial - aulas práticas de Química Física) da disciplina de Laboratórios de Química Física / Química Orgânica, destinada a alunos do 3º ano de Licenciaturas e Mestrados Integrados do Departamento de Química da Universidade de Aveiro.
- Teve a seu cargo 1 turma (componente laboratorial - aulas práticas) da disciplina de Química Geral, destinada a alunos do 1º ano de diversas Licenciaturas e Mestrados Integrados nas áreas das Ciências e das Engenharias da Universidade de Aveiro.

2019/20
- Teve a seu cargo 1 turma (componente laboratorial - aulas práticas de Química Física) da disciplina de Laboratórios de Química Física / Química Orgânica, destinada a alunos do 3º ano de Licenciaturas e Mestrados Integrados do Departamento de Química da Universidade de Aveiro.
- Teve a seu cargo 1 turma (componentes teórica e prática) da disciplina de Modelação e Computação Científica, destinada a alunos do 4º ano do Mestrado Integrado em Engenharia Computacional da Universidade de Aveiro.
- Teve a seu cargo 1 turma (componentes teórica e prática) da disciplina de Química Computacional, destinada a alunos do Mestrado em Química da Universidade de Aveiro.

2020/21
- Tem a seu cargo 1 turma (componentes teórica e prática) da disciplina de Modelação e Computação Científica, destinada a alunos do 4º ano do Mestrado Integrado em Engenharia Computacional da Universidade de Aveiro.

 

Últimas Notícias


orientações científicas em curso


Projectos


 
Apoio

1suponsers_list_ciceco.jpg