José Richard Baptista Gomes
  Investigador Principal  
   
  telefone: 234 401 423  
  extensão: 24 923  
  e-mail: jrgomes@ua.pt  
  departamento: Química  
  gabinete: 29.3.34  
   
  grupo: 6 - simulação computacional e modelação multi-escala
 
  linha: 1 - tecnologias da informação e comunicação
 
  url directo: http://www.ciceco.ua.pt/JoseRGomes  
   
Perfil biográfico

Researcher ID
ORCID

 

1991-1995
- Licenciatura em Química, Faculdade de Ciências da Universidade do Porto.

1995-2000
- Doutoramento em Química pela Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (área da Química Computacional), onde se dedicou ao estudo de processos químicos sobre superfícies de metais de transição, sob a supervisão do Prof. Doutor José A. N. Ferreira Gomes. Grau obtido no dia 5 de Janeiro de 2000.

2000
- Pós-doutoramento no Departament de Química Física da Facultat de Química de Barcelona, Espanha, onde fez trabalho de investigação sobre a adsorção em óxidos metálicos, no âmbito de um programa de pós-doutoramento sob orientação do Prof. Doutor Francesc Illas;

2001-2007
-Investigador pós-doutoral no grupo de Termoquímica da Faculdade de Ciências do Porto, dedicando-se à aplicação de técnicas de Química-Computacional em estudos estruturais e termodinâmicos de compostos aromáticos heterocíclicos e de complexos de coordenação com metais de transição, sob a orientação do Prof. Doutor Manuel A. V. Ribeiro da Silva.


2007-2012
- Investigador auxiliar (programa Ciência 2007) no Laboratório Associado CICECO.

2012-2013
- Investigador auxiliar no Laboratório Associado CICECO.

2013-present
- Investigador principal (programa Investigador FCT) no Laboratório Associado CICECO.

Interesses científicos

Uso de computadores e métodos computacionais em química.


Palavras-chave:

- Estrutura molecular
- Termoquímica em fase gasosa
- Perfis de reacções em fase gasosa
- Adsorção química e/ou física
- Reacções em superfícies (metálicas ou óxidos metálicos)
- Catálise heterogénea

Projectos financiados

ATIVOS

Membro da equipa do projeto Delivery vehicles of therapeutic gasotransmitters NO and H2S based on nanoporous materials (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. PTDC/MED-QUI/28721/2017, de 01-10-2018 a 30-09-2021).

Co-investigador principal do projeto DataCor - Smart Data to Design Corrosion Inhibitors (Compete 2020, ref. PTDC/QUI-QFI/30256/2017, de 16-07-2018 a 15-07-2021).

Investigador principal do projeto SILVIA - Modeling the synthesis of silica materials via multiscale computer simulations (Programa Operacional Centro 2020, ref. PTDC/QUI-QFI/31002/2017, de 01-06-2018 a 31-05-2021).

Membro da equipa do projeto UNIRCELL - Unitised regenerative fuel cell for efficient renewable energy supply: from materials to device (FCT-COMPETE / Programas de Atividades Conjuntas do Portugal 2020, ref. POCI-01-0145-FEDER-016422, de 01-01-2017 a 31-12-2019).

Membro da equipa do projeto TUBITAK - Phase transitions and ferroelectricity in self-assembled peptides nanotubes (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. TUBITAK/0006/2014, de 01-10-2016 a 30-09-2019).

Investigador principal do projeto SELMA - Unveiling the self-healing mechanisms associated with smart nanocontainers (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. PTDC/QEQ-QFI/4719/2014, de 01-06-2019 a 31-05-2019).

Membro da equipa do projeto Variable pressure solid-state NMR methods to study gas-surface interactions in nanoporous sorbent materials for industrial post/pre-combustion CO2 capture (Fundação para a Ciência e a Tecnologia, ref. PTDC/QEQ-QAN/6373/2014, de 01-02-2016 a 31-01-2019).

Membro da equipa do projeto SUSPHOTOSOLUTIONS - Soluções Fotovoltaicas Sustentáveis (Programa Operacional Centro 2020, ref. CENTRO-01-0145-FEDER-000005).

Membro da equipa do projeto SGH - Smart Green Homes (Sistema de Incentivos à I&D Empresarial, ref. POCI-01-0247-FEDER-007678).

 

CONCLUÍDOS

-EXPL/QUI-COM/0927/2013: FISHING - Fishing falcipain hit inhibitors from Malaria Boxes: in silico target deconvolution model development and validation (Co-principal Investigator).

-PTDC/QUI-QUI/117439/2010: Computational Design of New Catalysts for the Water Gas Shift Reaction (Principal Investigator).

-PTDC/QUI-QUI/109914/2009: Theoretical study of silicate chemistry in the synthesis of nanoporous materials (Principal Investigator).

-PTDC/EQU-EQU/100476/2008: Synthesis and characterization of new microporous niobium silicate and titanosilicate membranes and their application to the separation of hydrogen containing mixtures (Team member).

-PTDC/QUI-QUI/100998/2008: Development of high-resolution 1H solid-state NMR methods and applications on materials and molecules of biological interest (Team member).

-PTDC/EQU-EQU/099423/2008: Intelligent design of mesoporous organosilicas for adsorptive separation processes (Team member).

Publicações seleccionadas

Lista completa: http://sweet.ua.pt/jrgomes/publications.html

Publicações mais recentes:

2018

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Gas-organic and gas-inorganic interfacial effects in gas-adsorbent interactions: The case of CO2/CH4 separation
M. A. O. Lourenço, José R. B. Gomes, P. Ferreira
in, Hybrid organic-inorganic interfaces: Towards advanced functional materials, Eds. M. -H. Delville and A. Taubert, Wiley-VCH, January 2018. ISBN: 978-3-527-34255-6. [link]
 

2017

Gas-organic and gas-inorganic interfacial effects in gas-adsorbent interactions: The case of CO2/CH4 separation
M. A. O. Lourenço, José R. B. Gomes, P. Ferreira
in, Hybrid organic-inorganic interfaces: Towards advanced functional materials, Eds. M. -H. Delville and A. Taubert, Wiley-VCH, January 2018. ISBN: 978-3-527-34255-6.

Periodic mesoporous organosilica with low thiol density - a safer material to trap Hg(II) from water
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Carbonization of periodic mesoporous phenylene- and biphenylene-silicas for CO2/CH4 separation
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Simple, mono and bifunctional periodic mesoporous organosilicas for removal of priority hazardous substances from water: the case of mercury(II)
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Molecular Simulations of the Synthesis of Periodic Mesoporous Silica Phases at High Surfactant Concentrations
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Corrosion Inhibition of Copper in Aqueous Chloride Solution by 1H-1,2,3-Triazole and 1,2,4-Triazole and their Combinations: Electrochemical, Raman and Theoretical Studies
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Selectivity for CO2 over CH4 on a Functionalized Periodic Mesoporous Phenylene-Silica Explained by Transition State Theory
C. Kunkel, F. Viñes, M. A. O. Lourenço, P. Ferreira, José R. B. Gomes, F. Illas
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Understanding polymorphic control using imidazolium-based ionic liquid mixtures as crystallization directing agents
Inês C. B. Martins, José R. B. Gomes, M. T. Duarte, L. Mafra
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How DFT Surface Energies May Explain the Morphology of Particles, Nanosheets and Conversion Films based on Layered Double Hydroxides
T. L. P. Galvão, C. Neves, M. L. Zheludkevich, José R. B. Gomes, J. Tedim, M. G. S. Ferreira
J. Phys. Chem. C, 121 (2017) 2211. [link]

Adsorption of CO on the Rutile TiO2(110) Surface: A Dispersion-Corrected Density Functional Theory Study
J. P. Prates Ramalho, F. Illas, José R. B. Gomes
Phys. Chem. Chem. Phys., 19 (2017) 2487. [link]

The structure of chemisorbed CO2 species in amine-functionalized mesoporous silicas studied by solid-state NMR and computer modeling
L. Mafra, T. Čendak, S. Schneider, P. V. Wiper, J. Pires, José R. B. Gomes, M. L. Pinto
J. Am. Chem. Soc. 139 (2017) 389. [link]

A Transferable Model for Adsorption in MOFs with Unsaturated Metal Sites
C. Campbell, C. Ferreiro-Rangel, M. Fischer, José R. B. Gomes, M. Jorge
J. Phys. Chem. C 121 (2017) 441. [open access]

Thermochemical studies on two alkyl-bulky substituted xanthene derivatives: 9,9-dimethylxanthene and 2,7-di-tert-butyl-9,9-dimethylxanthene
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Principais colaboradores
  • Nacionais:
    • Prof. Doutor João Paulo Prates Ramalho (Universidade de Évora);
    • Doutor Luís Mafra (Universidade de Aveiro);
    • Doutor Moisés Luzia Pinto (Instituto Superior Técnico);
    • Doutora Paula Ferreira (Universidade de Aveiro);
    • Prof. Doutor João Coutinho (Universidade de Aveiro);
    • Doutor João Tedim (Universidade de Aveiro);
    • Doutor Filipe Figueiredo (Universidade de Aveiro).

 

  • Internacionais:
    • Prof. Doutor Francesc Illas (Universidade de Barcelona, Espanha);
    • Doutor Francesc Viñes (Universidade de Barcelona, Espanha);
    • Doutor Miguel Jorge (Universidade de Strathclyde, Reino Unido);
    • Doutor Michael Fischer (Universidade de Bremen, Alemanha).
Grupo de Investigação

Investigadores Doutorados – Post-Docs:

  • Rui Vieira Afonso (Portugal) – co-orientação com Doutor Luís Mafra, Aveiro. Bolseiro pós-doutoramento do Projeto SGH - Smart Green Homes (POCI-01-0247-FEDER-007678) a partir de 8 de Maio de 2017 até ao presente. Cálculos DFT da interação de pequenas moléculas com adsorventes sólidos.
  • Tiago Luís Pereira Galvão (Portugal) – co-orientação com Doutor João Tedim, Aveiro. Bolseiro pós-doutoramento do Projeto SELMA (PTDC/QEQ-QFI/4719/2014) a partir de 1 de Agosto de 2016 até ao presente. Cálculos DFT da interação de inibidores de corrosão com hidróxidos lamelares duplos.
  • José Luis Cagide Fajín (Espanha) - co-orientação com Prof. Doutora Natália Cordeiro, Porto. Bolseiro pós-doutoramento FCT (SFRH/BPD/27167/2006); FCT (SFRH/BPD/64566/2009) a partir de 1 de Novembro de 2006 até ao presente. Cálculos DFT de reações de catálise heterogénea.
  • Daniel Muñoz Gil (Espanha) – co-orientação com Doutor Filipe Figueiredo, Aveiro. Bolseiro do Projeto FCT (SAICTPAC/0032/2015) a partir de Janeiro de 2018. Cálculos DFT da interação de água com materiais derivados do ZIF-8.

 

Estudantes de Doutoramento:

  • Manon Wilhelm (França) – co-orientação com Doutor João Tedim, Aveiro. Cálculos DFT com vista ao desenho de novos eletrocatalisadores para a dissociação de água.
  • Mehriban Aliyeva (Azerbaijão) – co-orientação com Prof. Doutor João Coutinho, Aveiro. Simulações de dinâmica molecular clássica de fragmentos proteicos em soluções aquosas.
  • Bruno Zêzere (Portugal) – co-orientação com Prof. Doutor Carlos Silva, Aveiro. Simulações de dinâmica molecular clássica para o cálculo de coeficientes de difusão de compostos bioativos em fluidos supercríticos e em líquidos.

 

Actividade pedagógica

Universidade do Porto

1996/97
- Foi monitor da disciplina de Introdução à Química I das Licenciaturas de Física, de Física e Tecnologia dos Materiais e de Optoelectrónica e Lasers, da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, tendo a seu cargo a leccionação das aulas práticas (componentes teórico-práticas e laboratorial).

1998/99
- Foi monitor da disciplina de Tecnologias de Informação e Comunicação da Licenciatura em Química, da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, tendo a seu cargo a leccionação das aulas práticas.
- Foi monitor da disciplina de Energia e Organização em Sistemas Biológicos da Licenciatura em Bioquímica, da mesma Faculdade, tendo a seu cargo a leccionação das aulas práticas.

2002-2007
- Leccionou uma aula/4h subordinada ao tema “Aplicação da Química Computacional em Estudos Termoquímicos”, no âmbito da disciplina de Termoquímica, opção da Licenciatura em Química da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, a convite da Profª Doutora Maria das Dores M. C. Ribeiro da Silva.

Co-autor da publicação pedagógica:
Termoquímica: Aulas práticas (disciplina de opção do 3º ano da Licenciatura em Química) Maria das Dores M. C. Ribeiro da Silva, Luís M. N. B. F. Santos, José R. B. Gomes Departamento de Química, Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, Fevereiro de 2005.

 

Universidade de Aveiro

2015/16
- Leccionou o módulo de Visualização e Modelação Molecular (56 h) da disciplina de Bioinformática e Estrutura Molecular destinado a alunos do 3º ano das Licenciaturas em Bioquímica e em Biotecnologia.

2016/17
- Teve a seu cargo 4 turmas (componente laboratorial - aulas práticas) da disciplina de Elementos de Química Física, destinado a alunos do 1º ano de diversas Licenciaturas e Mestrados Integrados nas áreas das Ciências e das Engenharias da Universidade de Aveiro.
- Teve a seu cargo 2 turmas (componente laboratorial - aulas práticas) da disciplina de Química Geral, destinado a alunos do 1º ano de diversas Licenciaturas e Mestrados Integrados nas áreas das Ciências e das Engenharias da Universidade de Aveiro.

2017/18
- Teve a seu cargo 2 turmas (componente laboratorial - aulas práticas) da disciplina de Química Geral, destinado a alunos do 1º ano de diversas Licenciaturas e Mestrados Integrados nas áreas das Ciências e das Engenharias da Universidade de Aveiro.

2018/19
- Teve a seu cargo 2 turmas (componente laboratorial - aulas práticas de Química Física) da disciplina de Laboratórios de Química Física / Química Orgânica, destinado a alunos do 3º ano de Licenciaturas e Mestrados Integrados do Departamento de Química da Universidade de Aveiro.

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